Search results for "UNESCO::CIENCIAS DE LA VIDA::Biología molecular ::Biología molecular de microorganismos"
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Epidemiología molecular y genómica de aislados resistentes de Pseudomonas aeruginosa de origen hospitalario.
2019
Pseudomonas aeruginosa es un patógeno frecuente en entornos hospitalarios que acumula multitud de resistencias a antibióticos. Ante la dificultad de encontrar tratamiento efectivo, los pacientes están mucho tiempo colonizados y aumenta la probabilidad de transmisión. El principal objetivo del presente trabajo ha sido mostrar cómo el estudio evolutivo a nivel de genomas completos puede ser útil para la detección de transmisiones a diferentes niveles. Se decidió aplicar la misma metodología de reconstrucción de la filogenia a partir de las variantes encontradas en genomas completos que además se dataron por métodos bayesianos. Para ello, hemos contado con muestras de P. aeruginosa multirresis…
Omics approaches to study the oral microbiome
2015
Introducción La visión clásica de los microorganismos como agentes infecciosos ha propiciado que se consideren como meros agentes causales de enfermedades. Sin embargo, la larga historia de coexistencia entre microorganismos y los seres humanos, ha hecho que ambos se hayan adaptado mutuamente y coevolucionen (Dubos et al. 1965, McFall-Ngai 2002). De hecho, en el cuerpo humano habitan 1014 células bacterianas, un orden de magnitud más que células humanas (Savage 1977). Entre los beneficios que la microbiota aporta, están su contribución a digerir alimentos y a aportar nutrientes, regulación del metabolismo, maduración del sistema inmune, etc. Por ello, hoy en día las enfermedades de origen…
Hacia el entendimiento del control de la expresión génica del regulón clanobacteriano del nitrógeno mediado por el factor de transcripción NtcA y la …
2018
NtcA, es un factor de transcripción cianobacteriano perteneciente a la familia CRP. Es considerado el regulador global del nitrógeno en cianobacterias ya que presenta un regulón muy amplio que incluye muchos genes implicados en el metabolismo de nitrógeno. Se activa por 2-oxoglutarato(2-OG), un indicador del nivel de nitrógeno celular y es coactivado por una proteína llamada PipX, objeto importante de este estudio. A bajo nivel de 2-OG, PipX es secuestrada por la proteína señalizadora PII quedando inaccesible para activar NtcA. Sin embargo, la unión de 2-OG a PII en condiciones de escasez de nitrógeno, libera PipX, la cual queda accesible para coactivar NtcA. Las estructuras de NtcA unido a…
Estudio de la diversidad y evaluación de las relaciones fenotipo-genotipo para la búsqueda de cepas malolácticas de Oenococcus oeni
2015
El vino es una bebida obtenida por fermentación del mosto de uva. Durante la fermentación participan las levaduras y las bacterias lácticas que son responsables de la fermentación alcohólica y maloláctica, respectivamente. La fermentación alcohólica consiste fundamentalmente en la transformación de los azúcares del mosto en etanol y CO2, mientras que la fermentación maloláctica consiste en la conversión de ácido málico, propio del mosto, en ácido láctico y CO2. De todas las especies de bacterias lácticas relacionadas con la vinificación, Oenococcus oeni es la responsable generalmente de la FML, ello se debe a que es la que mejor tolera las condiciones estresantes del vino. Por esta razón, e…
Comparative genomics to unravel adaptive mechanisms in Saccharomyces
2021
Saccharomyces genus is a fascinating model for evolutionary biology due to its high genetic and phenotypic diversity. The improvement in the sampling efforts during the last decade has resulted in the isolation of Saccharomyces species from a wide range of sources worldwide. S. cerevisiae is probably the most well known eukaryotic system and the dominant organism in most industrial fermentations. Due to the new challenges of the winemaking industry (e.g., global warming and changing customer demands), alternative Saccharomyces species have attracted researchers’ attention during the last decade as a poorly exploited resource of biodiversity. S. kudriavzevii and S. uvarum are two promising c…
Patrones estructurales y funcionales de las comunidades de procariotas en humedales mediterráneos y su relación con el ciclo del carbono
2023
Las zonas húmedas mediterráneas juegan un papel muy importante en los ciclos biogeoquímicos, ya que la presencia de agua, de forma constante o transitoria, favorece unas altas tasas metabólicas. Respecto al ciclo del carbono, los humedales mediterráneos se ven activamente involucrados en la captación o en la emisión de gases de efecto invernadero carbonados (C-GEI) hacia la atmósfera, concretamente el dióxido de carbono y el metano. Esta relevancia de los humedales en el ciclo del carbono se debe, en parte, a la actividad de las comunidades de procariotas que habitan en el agua y en el sedimento de las zonas húmedas, puesto que la abundancia y versatilidad metabólica de los procariotas les …
Caracterización de los componentes genéticos y ambientales implicados en el envejecimiento de las levaduras vínicas
2012
La mayor parte de la fermentación vínica discurre cuando las células de la levadura Saccharomyces cerevisiae han dejado de dividirse. Así pues, la viabilidad en fase estacionaria, llamada longevidad cronológica (LC), es esencial para que la vinificación se lleve a buen término. En este trabajo de tesis doctoral, se han caracterizado diversos componentes ambientales y genéticos que influyen en la longevidad cronológica de las levaduras vínicas. En cuanto a los componentes ambientales, el incremento de la acidez y la temperatura del medio promueven el envejecimiento. Los polifenoles resveratrol y quercetina y los compuestos de dos carbonos que se producen durante la fermentación, afectan de m…
Optimizing Nanopore-based microbiome sequencing for characterizing biotechnologically-relevant ecosystems
2022
La secuenciación de siguiente generación (NGS) ha cambiado completamente la manera en la que estudiamos el mundo microbiano. A lo largo de los últimos años, las plataformas Illumina han sido las más usadas para secuenciar ADN. No obstante, la secuenciación por nanoporos, un nuevo método impulsado por Oxford Nanopore Technologies (ONT), está incrementando gradualmente su popularidad dadas sus múltiples ventajas sobre las plataformas NGS. Estas ventajas incluyen la portabilidad y la capacidad para generar secuencias largas en tiempo real. A pesar de estos avances, la adopción de la secuenciación ONT se ha visto limitada por la elevada tasa de error asociada a esta tecnología en comparación co…
Genomic epidemiology: from transmission to the evolution of pathogenic microorganisms
2022
La epidemiología genómica ha revolucionado el mundo microbiano. Sus aplicaciones permiten conocer y comprender mejor el comportamiento, la transmisión y la evolución de los microorganismos. A pesar de su gran y reconocido potencial, su uso aún es limitado, especialmente en regiones en desarrollo. El principal objetivo de esta tesis fue estudiar y analizar los genomas completos de tres microorganismos patógenos y zoonóticos para comprender mejor su epidemiología, potencial patogénico y evolución. En el primer capítulo caracterizamos a nivel genómico a Salmonella enterica aislada de alimentos, fincas y muestras clínicas en Ecuador. Además, presentamos evidencia de la presencia de factores de …
Genome Characterization of natural Saccharomyces hybrids of biotechnological interest
2012
At present, the genus Saccharomyces comprises seven species according to their patterns of breeding. The species boundaries are not clear due to the description of several reticulate events due to introgression and hybridization. In the last decade, new natural hybrids have been described in wine and brewing, such as S. cerevisiae x S. kudriavzevii. Due to new practices in wine and beer production, together with consequences in grape properties due to climatic change, led biotechnological companies to search for new yeast strains. In this context, hybrids have become of importance to biotechnological industries because they show good fermentative performance at low temperatures and produce …